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A probabilistic template model for finding macromolecules in MET volume images

机译:用于在MET体积图像中查找大分子的概率模板模型

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摘要

We introduce and investigate probabilistic templates with particular focus on the application of protein identification in electron tomography volumes. We suggest to create templates with a weighted averaging operation of several object instances after alignment of an identified subpart. The subpart to be aligned should, ideally, correspond to a rigid and easily identifiable part of the object. The proposed templates enable common rigid template matching methods to also find different shape variations without increasing time complexity in the actual search procedure, since a static template is still used. We present general ideas on how to perform the object instance alignment and look specifically at how to do it for the antibody macromolecule IgG.
机译:我们介绍和研究概率模板,特别侧重于电子断层扫描中蛋白质鉴定的应用。我们建议在对齐已标识的子部件之后,使用多个对象实例的加权平均运算来创建模板。理想情况下,要对齐的子部分应对应于对象的刚性且易于识别的部分。所提出的模板使普通的刚性模板匹配方法能够在不增加实际搜索过程中时间复杂度的情况下找到不同的形状变化,因为仍然使用静态模板。我们提出了有关如何执行对象实例比对的一般思路,并专门研究如何针对抗体大分子IgG进行对齐。

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